Amino Acid Reference
아미노산 20종 구조/성질/1-3문자 코드 레퍼런스
Amino Acid Reference 소개
아미노산 레퍼런스는 20종 표준 아미노산과 21번째 아미노산인 셀레노시스테인까지 포괄하는 생화학 참고 자료입니다. 각 항목에는 1문자 코드, 3문자 약어, 분자량(Da), 등전점(pI), 측쇄 구조, 인산화 부위, 이황화 결합 형성, UV 흡수 특성 등 핵심 생화학적 역할이 상세하게 정리되어 있습니다.
개별 아미노산 외에도 Kyte-Doolittle 소수성 척도, 모든 이온화기의 pKa 값, 서열 정렬에 사용되는 보존적 치환 그룹(BLOSUM62), 9종 필수 아미노산 목록 등 생화학 핵심 분류 데이터를 제공합니다. 생화학, 분자생물학, 생물정보학 시험 준비에 필수적인 내용을 모두 다루고 있습니다.
비극성, 극성 비전하, 산성(음전하), 염기성(양전하), 아미노산 분류, 특수 아미노산의 6개 카테고리로 체계적으로 구성되어 있어, 이름, 코드, 물성, 카테고리별로 빠르게 검색할 수 있습니다. 시험 대비, 단백질 분석, 실험실 참고 자료로 활용하기에 적합합니다.
주요 기능
- 20종 표준 아미노산의 분자량, pI, 측쇄 구조, 1문자/3문자 코드 완비
- Kyte-Doolittle 소수성 지수: Ile(4.5)부터 Arg(-4.5)까지 전 잔기 수록
- alpha-COOH, alpha-NH3+ 및 모든 이온화 측쇄(Asp, Glu, His, Cys, Tyr, Lys, Arg)의 pKa 값
- 서열 정렬과 BLOSUM62 해석을 위한 보존적 치환 그룹 정리
- 방향족 아미노산 UV 흡수 데이터(Trp 280nm, Tyr 274nm, Phe 257nm)와 흡광계수
- 필수 아미노산 9종 식별 및 암기법, 조건부 필수 아미노산 목록
- 셀레노시스테인(Sec/U)의 UGA 코돈과 SECIS 요소 정보 수록
- 한국어/영어 이중 언어 지원, 카테고리 필터링과 즉시 검색 기능
자주 묻는 질문
필수 아미노산 9종은 무엇인가요?
식이를 통해 반드시 섭취해야 하는 9종 필수 아미노산은 히스티딘(H), 이소류신(I), 류신(L), 라이신(K), 메티오닌(M), 페닐알라닌(F), 트레오닌(T), 트립토판(W), 발린(V)입니다. 아르기닌, 시스테인, 글루타민, 티로신, 프롤린, 글리신은 조건부 필수 아미노산으로 분류됩니다.
아미노산의 등전점(pI)은 어떻게 결정하나요?
pI는 아미노산의 순 전하가 0이 되는 pH입니다. 단순 아미노산은 alpha-COOH와 alpha-NH3+의 pKa 평균입니다. 이온화 측쇄가 있는 아미노산은 양쪽성 이온 형태를 둘러싼 두 pKa의 평균으로 구합니다. 예를 들어 Asp의 pI = (2.09 + 3.65)/2 = 2.77입니다.
280nm에서 UV를 흡수하는 아미노산은 무엇인가요?
트립토판(280nm, 흡광계수 5,500), 티로신(274nm, 1,490), 페닐알라닌(257nm, 약함)이 UV를 흡수하는 방향족 아미노산입니다. A280 단백질 정량 공식: e280 = nTrp*5500 + nTyr*1490 + nCys*125로 단백질 농도를 추정합니다.
Kyte-Doolittle 소수성 척도란 무엇인가요?
Kyte-Doolittle 척도는 각 아미노산에 소수성 지수를 부여합니다. 이소류신(4.5, 가장 소수성)부터 아르기닌(-4.5, 가장 친수성)까지 범위를 가집니다. 막횡단 도메인 예측과 단백질 접힘 분석에 널리 사용되며, 슬라이딩 윈도우 평균이 1.8 이상이면 보통 막횡단 영역으로 판단합니다.
보존적 아미노산 치환이란 무엇인가요?
보존적 치환은 비슷한 물리화학적 성질을 가진 아미노산으로 교체하는 것입니다. 소수성(A, V, I, L, M), 방향족(F, Y, W), 양전하(K, R, H), 음전하(D, E), 극성(S, T, N, Q) 그룹으로 나뉘며, BLOSUM62 행렬에서 양의 점수를 받아 단백질 기능이 대체로 보존됩니다.
글리신이 아미노산 중 독특한 이유는 무엇인가요?
글리신은 측쇄가 수소 원자(-H) 하나뿐인 가장 작은 아미노산으로, 표준 아미노산 중 유일하게 비키랄(achiral)입니다. 작은 크기 덕분에 골격 유연성이 뛰어나며, 콜라겐 구조에서 Gly-X-Y 반복의 매 세 번째 위치에 필수적으로 존재합니다.
시스테인은 단백질 구조에서 왜 중요한가요?
시스테인은 pKa 8.3의 티올(-SH) 측쇄를 가지고 있어 다른 시스테인과 이황화 결합(S-S)을 형성합니다. 이 공유결합은 특히 분비 단백질에서 3차·4차 구조를 안정화시키며, 아연 핑거 모티프에서 아연을 배위하고 효소 활성 부위에서 친핵체로 작용합니다.
셀레노시스테인은 무엇이며 어떻게 코딩되나요?
셀레노시스테인(Sec, U)은 시스테인의 티올 대신 셀레놀(-SeH) 기를 가진 21번째 아미노산입니다. 일반적으로 종결 신호인 UGA 코돈으로 코딩되지만, mRNA에 SECIS(Selenocysteine Insertion Sequence) 요소가 있을 때 Sec로 해독됩니다. 글루타치온 퍼옥시다제 등 셀레노단백질에서 발견됩니다.