Enzyme Commission Reference

효소 EC 번호/반응/기질 레퍼런스

26개 결과

Enzyme Commission Reference 소개

EC 번호 레퍼런스는 IUBMB 효소 분류 체계의 종합 가이드로, 7가지 주요 효소 분류를 모두 다룹니다: EC 1 산화환원효소, EC 2 전이효소(키나아제 포함), EC 3 가수분해효소(프로테아제, 포스파타제, 리파아제), EC 4 분해효소, EC 5 이성질화효소, EC 6 연결효소, EC 7 전위효소(2018년 신설, Na+/K+-ATPase 등 막수송 효소). 4단계 EC 번호 체계(EC A.B.C.D)를 실제 예시와 함께 설명합니다.

주요 효소 항목에서는 단백질 세린/트레오닌 키나아제(EC 2.7.11.1, PKA, PKC, CDK, MAPK, Akt), 수용체 타이로신 키나아제(EC 2.7.10.1, EGFR, HER2, VEGFR), 세린 프로테아제(EC 3.4.21, 촉매 삼잔기 Ser-His-Asp), 시스테인 프로테아제(EC 3.4.22, 카스파제), 아스파르트산 프로테아제(EC 3.4.23, HIV 프로테아제), LDH(EC 1.1.1.27), 퍼옥시다아제/HRP(EC 1.11.1.7), ALP(EC 3.1.3.1), DNase I(EC 3.1.21.1)을 상세히 다룹니다.

효소 동역학 섹션에서는 미카엘리스-멘텐 방정식(Km, Vmax, kcat, 촉매 효율 kcat/Km), 억제 유형(경쟁적, 비경쟁적, 무경쟁적, 혼합형), Lineweaver-Burk 이중역수 도표, 알로스테릭 조절(Hill 방정식, 협동성)을 다루며, BRENDA, KEGG, ExPASy, UniProt 데이터베이스 가이드를 제공합니다.

주요 기능

산화환원효소부터 전위효소(2018)까지 7가지 EC 효소 분류와 하위 분류 세부 정보
반응 유형과 기질 특이성을 설명하는 4단계 EC 번호 체계(EC A.B.C.D)
단백질 키나아제(PKA, PKC, CDK, MAPK, Akt)와 수용체 타이로신 키나아제(EGFR, HER2, VEGFR) 및 억제제 예시
프로테아제 패밀리: 세린(트립신, 트롬빈), 시스테인(카스파제), 아스파르트산(펩신, HIV 프로테아제)과 촉매 기전
임상 효소: LDH 아이소자임, ALP 조직 유형, HRP ELISA 기질, DNase I 응용
미카엘리스-멘텐 동역학: Km 기질 친화도, Vmax, kcat 회전수, 촉매 효율
4가지 억제 유형(경쟁적, 비경쟁적, 무경쟁적, 혼합형)과 Lineweaver-Burk 도표 패턴
효소 데이터베이스: BRENDA 동역학 데이터, KEGG 대사경로 매핑, ExPASy 명명법, UniProt 서열/기능 검색

자주 묻는 질문

7가지 EC 효소 분류는 무엇인가요?

EC 1 산화환원효소(산화환원 반응), EC 2 전이효소(작용기 전달, 키나아제 포함), EC 3 가수분해효소(물을 이용한 결합 절단), EC 4 분해효소(비가수분해적 결합 절단), EC 5 이성질화효소(분자 내 재배열), EC 6 연결효소(ATP 결합 형성), EC 7 전위효소(막 수송, 2018년 신설, Na+/K+-ATPase, ABC transporter 등)입니다.

EC 번호 체계는 어떻게 작동하나요?

EC 번호는 4단계 형식(EC A.B.C.D)을 따릅니다: A는 주반응 유형(1-7), B는 작용기/기질 소분류, C는 구체적 기질/보조효소, D는 특정 효소 일련번호입니다. 예를 들어 EC 2.7.11.1은 전이효소(2), 인산전이효소(7), 세린/트레오닌 키나아제(11), 비특이적(1)을 의미합니다.

어떤 단백질 키나아제를 다루나요?

EC 2.7.11.1 단백질 세린/트레오닌 키나아제로 PKA, PKC, CDK, MAPK(ERK, JNK, p38), Akt/PKB, CK2를 다룹니다. EC 2.7.10.1 수용체 타이로신 키나아제로 EGFR, HER2, VEGFR, PDGFR, FGFR, 인슐린 수용체와 Imatinib, Gefitinib, Sunitinib 등 임상적으로 중요한 억제제를 포함합니다.

프로테아제 패밀리의 차이점은 무엇인가요?

세린 프로테아제(EC 3.4.21)는 Ser-His-Asp 촉매 삼잔기를 가지며 트립신, 키모트립신, 트롬빈을 포함하고 PMSF/Aprotinin으로 억제합니다. 시스테인 프로테아제(EC 3.4.22)는 파파인과 카스파제(세포사멸 핵심)를 포함하며 E-64, Z-VAD-FMK로 억제합니다. 아스파르트산 프로테아제(EC 3.4.23)는 산성 pH 최적이며 펩신, 레닌, HIV 프로테아제, BACE를 포함합니다.

미카엘리스-멘텐 동역학은 어떻게 설명하나요?

v = Vmax[S]/(Km + [S]) 방정식에서 Km은 반최대속도 기질 농도(낮은 Km = 높은 친화도)입니다. kcat(회전수) = Vmax/[E]total이며, kcat/Km이 촉매 효율을 나타내고 확산 제한은 10^8-10^9 M-1s-1입니다. 예시로 헥소키나아제(Km = 0.1 mM 포도당)와 글루코키나아제(Km = 10 mM)를 비교합니다.

효소 억제 유형은 어떤 것을 다루나요?

4가지 유형을 설명합니다: 경쟁적(기질과 경쟁, Km 증가, Vmax 불변, 예: Methotrexate vs DHFR), 비경쟁적(Km 불변, Vmax 감소), 무경쟁적(ES 복합체에만 결합, Km/Vmax 모두 감소), 혼합형(모두 변화). Lineweaver-Burk 도표에서 기울기와 절편 변화로 각 유형을 구분합니다.

어떤 효소 데이터베이스를 참조하나요?

BRENDA(brenda-enzymes.org)는 Km, kcat, Ki 값, 최적 pH/온도, 억제제, 질병 정보를 제공합니다. KEGG Enzyme은 효소를 대사경로에 매핑하며 REST API 접근이 가능합니다. ExPASy ENZYME은 명명법과 이전 EC 번호 추적을 제공합니다. UniProt는 EC 번호로 서열, 활성 부위, 돌연변이, GO annotation을 검색할 수 있습니다.

임상 효소 응용은 어떤 것이 포함되나요?

LDH(EC 1.1.1.27) 아이소자임 LDH1-5로 심장/간 마커(정상 140-280 U/L), ALP(EC 3.1.3.1) 아이소자임으로 골/간담도 질환(정상 44-147 U/L), HRP(EC 1.11.1.7)로 ELISA 검출(TMB/DAB/ECL 기질), DNase I(EC 3.1.21.1)로 footprinting, RNA 추출 시 DNA 제거, DNase-seq 염색질 접근성 분석을 다룹니다.